Klinická multiomika: čo znamená pre liečbu rakoviny

Klinická multiomika — integrácia genomiky, transkriptomiky, proteomiky, metabolomiky a epigenomiky — sa presúva z výskumu do každodennej onkologickej praxe. Spojením viacerých molekulárnych vrstiev môžu lekári získať komplexnejší obraz o nádore, než poskytuje ktorýkoľvek samostatný test.

Čo je klinická multiomika?

Klinická multiomika je praxe analýzy viacerých typov molekulárnych dát od pacienta — DNA, RNA, proteínov, metabolitov a epigenetických značiek — aby sa pochopilo, ako sa ochorenie správa. V onkológii to znamená pozerať sa na nádor z viacerých uhlov naraz, čo môže pomôcť pri personalizovanej voľbe liečby.

Lepšia predikcia ochorení vďaka klinickej multiomike

Najnovšie štúdie ukazujú, že v porovnaní so samotnými klinickými údajmi poskytuje integrácia genomiky, transkriptomiky, proteomiky, metabolomiky a epigenomiky lepšiu predikciu vzniku ochorení.

Rozpoznávanie pacientov, ktorí profitujú z liečby

Multiomika zlepšuje schopnosť rozpoznať pacientov, ktorí najpravdepodobnejšie získajú benefit z konkrétnej liečby, najmä v onkológii a imunoterapii.

Umelá inteligencia a integrácia multiomických dát

Umelá inteligencia, grafové učenie a sieťové modely sa stávajú kľúčovými metódami integrácie multiomických dát a identifikácie nových biomarkerov, podtypov ochorení a terapeutických cieľov.

Výskum rakoviny na úrovni jednotlivých buniek

Výskumu rakoviny pomáha možnosť skúmať jednotlivé bunky priamo v ich pôvodnom (!) tkanivovom prostredí.

Multiomika je dostupnejšia

Multiomika mení schopnosť skúmať jednotlivé bunky priamo v ich pôvodnom tkanive, čo poskytuje hlbší vhľad do heterogenity nádorov, progresie ochorenia a rezistencie voči liečbe. Mnohé výskumné pracoviská prijímajú automatizované procesy, čo tento výskum robí dostupnejším.

Niektoré klinické výsledky

• Predikcia, u ktorých pacientov je pravdepodobnosť vzniku invazívneho karcinómu pľúc (a potenciálne vyhnutie sa zbytočným biopsiám).
• Predikcia, u ktorých pacientov je pravdepodobnosť vzniku diabetu a kardiovaskulárnych ochorení.
• Predikcia, u ktorých pacientov je pravdepodobnosť benefitu z imunoterapie pri karcinóme pečene.
• Predikcia, ktorí pacienti so zriedkavými ochoreniami majú najväčší benefit z nového integrovaného genomického a transkriptomického sekvenovania.

Čo bude ďalej?

Pre rutinné využitie multiomiky v klinickej praxi stále existujú prekážky, medzi ktoré patria:

• Integrácia dát na rôznych molekulárnych úrovniach
• Neúplné datasety
• Problémy s reprodukovateľnosťou a konzistenciou
• Validácia vo veľkých klinických kohortách
• Náklady a praktickosť

Aj keď zjavné problémy a bariéry pretrvávajú, sme veľmi optimistickí. Sme presvedčení, že ďalším veľkým míľnikom v histórii nebude len zbieranie a analýza dát v doteraz nevídanej miere — bude to umelá inteligencia. Precízna medicína sa posunie za hranice spoliehania sa výhradne na DNA jednotlivca a bude sa opierať o viaceré biologické vrstvy pre presnejšiu diagnostiku, účinnejšie terapeutické možnosti a individualizovanú starostlivosť.

Multiomika je vo svojej záverečnej fáze testovania. Systémy a služby sa budú zameriavať na to, aby tento základný kameň výskumu zdokonaľovali rýchlejšie a efektívnejšie než čokoľvek, čo sme doteraz videli.

Ďalšie informácie: Going beyond genomics in precision oncology